Некоторые отличия мускари армянского от других видов этого растения:

• Форма цветков. 4 У мускари армянского — бочковидные цветки, собранные в кисть до 5 цветков. 4 Цветки с трубчатым околоцветником, окраска верхних — голубовато-синяя с белыми зубчиками, нижних — лиловая. 4
• Высота растения. 2 Мускари армянский достигает в высоту 15–20 см. 2
• Листья. 1 Узкие, линейные и мясистые, напоминают траву. 1 Часто слегка вогнуты и могут иметь слегка голубоватый (синевато-серый) оттенок. 1
• Плод. 1 Трёхдольная капсула, меняющая цвет от зелёного до зрелого коричневого по мере созревания. 1 Внутри — круглые чёрные семена. 1

Для сравнения, у других видов мускари могут быть свои особенности, например:

• Мускари широколистный (Muscari latifolium) имеет широко-ланцетные листья, напоминающие формой лист лилейника или тюльпана. 2 Соцветия более крупные, чем у других видов, высота цветоносов — до 20–25 см. 2
• Мускари гроздевидный (Muscari botryoides) получил своё название за плотные соцветия, напоминающие перевёрнутую кисть винограда. 2 Высота растений не превышает 10–15 см, крошечные бутоны собраны в короткие широко-пирамидальные соцветия. 2
• Мускари крупноплодный (Muscari macrocarpum) отличается от других видов мышиного гиацинта необычной окраской цветов. 2 Колосовидные соцветия состоят из лимонно-жёлтых бутонов. 2
• Мускари хохлатый (Muscari comosum) не похож на другие виды. 2 Его соцветия выглядят лохматыми из-за необычной формы бутонов с перьевидными лепестками. 2