Основное отличие федерального и регионального экологического контроля заключается в сферах, за которые отвечают разные уровни органов власти. 13

Федеральный экологический контроль осуществляют федеральные органы исполнительной власти. 34 Он проводится при ведении хозяйственной и иной деятельности с использованием объектов, которые находятся в ведении РФ и оказывают негативное воздействие на окружающую среду. 13 К таким объектам относятся, например, континентальный шельф РФ, внутренние морские воды и территориальное море страны, исключительная экономическая зона РФ, озеро Байкал. 4

Региональный экологический контроль проводят органы исполнительной власти субъектов РФ. 3 Он охватывает всю хозяйственную и иную деятельность, за исключением той, что ведётся с использованием объектов, которые подлежат федеральному экологическому контролю. 13

Таким образом, федеральный контроль охватывает более широкий круг объектов, в то время как региональный — конкретную сферу деятельности, за исключением определённой группы объектов.