Баргузинский заповедник отличается от других заповедников на Байкале рядом особенностей:

• Площадь и структура. 17 Площадь Баргузинского заповедника составляет 366 868 га, включая 15 тыс. га акватории шириной до 3 км. 1 Охраняемая территория разделена на две части: ядро заповедника, где запрещена любая хозяйственная деятельность, и биосферный полигон, куда допускаются туристы. 7
• Рельеф. 13 Горная цепь представлена гребнями зубчатой формы с острыми вершинами, максимальная высота на территории заповедника достигает 2652 м над уровнем моря. 1
• Флора и фауна. 13 В Баргузинском заповеднике насчитывается более 500 озёр небольшого размера, а флора включает 878 видов сосудистых растений, 212 видов лишайников и другие. 13 Фауна наземных позвоночных включает 41 вид млекопитающих, 281 вид птиц, 6 видов рептилий, 3 вида амфибий, 46 видов рыб и свыше 800 видов насекомых. 3

Байкальский заповедник, в свою очередь, располагается вдоль южного побережья озера Байкал на центральном участке горного хребта Хамар-Дабан и занимает территорию трёх районов Бурятии: Джидинского, Кабанского и Селенгинского 248. Площадь заповедной зоны превышает 167 000 га, а на её территории находятся ещё и два заказника федерального значения — Кабанский и Алтачейский. 4