Архитектура медресе Самарканда и других городов Средней Азии имеет свои особенности. 14 Некоторые из них:

• Для бухарских медресе, в противоположность самаркандским, характерен вход по оси с последующим разветвлением на два коридора, причём дворовый портал открывается ко входу большим зарешеченным окном. 1 По обе стороны от входа лежат залы мечети и аудитории-дарсханы. 1
• В Хиве почти все медресе имеют угловые башенки-гульдасты. 4 Двор перед порталом от внешнего мира закрывает невзрачная стенка. 5 Минареты заметно сужаются от основания к вершине, не расширяясь даже на уровне площадки. 5
• В Самарканде медресе не слагают единого стиля. 5 Например, в медресе Мирзо Улугбека, построенном в 1419 году, есть четыре угловых минарета, мечеть, две зимние и четыре летние аудитории, баня-омывальня и множество худжр. 4 В медресе Шердор, построенном в 1619 году, устроены два минарета по углам главного фасада и два невысоких минаретика-гулдаста в виде округлых контрфорсов, на заднем фасаде. 4

При этом для всех медресе Средней Азии характерна единая планово-пространственная структура. 1 Это монументальные сооружения с компактным прямоугольным объёмом и внутренним двором, в который обращены входы окружающих помещений и арки осевых айванов, двух или четырёх. 1 Главный фасад обычно отмечен портальным входом с вестибюлем, по сторонам которого возвышаются два купольных зала — зимней мечети и аудитории либо мавзолея. 1