Географическое деление Финского залива на три части (внешняя, внутренняя и Невская губа) объясняется различиями в гидрографических, гидрологических и гидрохимических условиях разных районов залива. 3

Внешняя часть примыкает к Балтийскому морю, здесь господствуют морские экосистемы, на дне наблюдаются гипоксийные условия. 3 На гидрологический и гидрохимический режимы этой акватории большое влияние оказывают затоки солёных вод из Центральной Балтики. 3

Восточная часть представляет собой переходный район от пресноводного водоёма к солоноватому. 13 На режим солёности воды значительное опресняющее влияние оказывает сток вытекающей из Ладожского озера реки Невы и других впадающих в залив рек. 1

Невская губа — район от устья Невы до дамбы, где вода практически пресная. 2 Сток Невы очень большой (около 80 куб. км в год), поэтому вода в этой части залива практически пресная. 2