Казацкий можжевельник отличается от других видов можжевельника по следующим признакам:

• Запах. 1 Если потереть молодую веточку, то почувствуется резкий, специфический запах, возникающий из-за большого содержания нескольких токсичных соединений, в том числе и эфирного масла. 1

• Побеги и шишкоягоды. 1 В отличие от можжевельника обыкновенного, побеги и шишкоягоды казацкого крайне ядовиты. 1 В кулинарии их не используют. 1

• Рост. 3 В редких случаях высота казацкого можжевельника достигает 1,5–2 м, но гораздо чаще этот вид вырастает не более 80–100 см. 3

• Хвоя. 3 Ярко-зелёная мягкая хвоя, которую многие агрономы называют чешуйчатыми листьями. 3 Привычная хвоя у него тоже есть, но преимущественно на молодых побегах или на нижних бесплодных ветвях. 3