Возможно, имелись в виду автоподстановки, которые используются в программе «1С:Документооборот». 1
Предметные автоподстановки зависят от предмета, для их выбора нужно добавить предмет в шаблон процесса. 5
Процессные автоподстановки можно создавать в общем модуле «ШаблоныБизнесПроцессовПереопределяемый». 1
Таким образом, разница между предметными и процессными автоподстановками в том, что первые зависят от предмета, а вторые можно создавать в рамках определённого процесса.