Двухтактные мотоциклы «Иж Юпитер» критиковали за ненадёжность и плохое качество сборки. 1 Некоторые причины:

• Большое количество клеммных соединений в электропроводке. 2 Это приводило к отказам различных узлов электрооборудования. 2
• Слабый коленчатый вал. 2
• Высокие обороты максимальной мощности. 2 В отсутствие качественных смазочных материалов это приводило к быстрому износу и выходу из строя деталей цилиндро-поршневой группы мотоцикла. 2
• Проблема синхронизации работы цилиндров. 1 Её приходилось решать спустя несколько тысяч километров (иногда раньше). 1

Также отмечалось, что мотоцикл требователен к нормальным комплектующим и может быть непредсказуем: мог проехать некоторое расстояние без проблем, а затем выйти из строя. 3

Важно учитывать, что надёжность техники во многом зависит от ухода и обслуживания владельца: некоторые пользователи могли не менять масло и не обращать внимания на стуки, что приводило к поломке. 5