Некоторые отличия Honda Civic Type R 1999 года от более поздних моделей:

• Двигатель: в 1999 году автомобиль оснащался двигателем B16B объёмом 1,6 литра и системой газораспределения DOHC VTEC. 14 В последующих моделях, например в Civic Type R 2 (EP3), серию двигателей B16 сменили двухлитровые моторы K20. 4
• Трансмиссия: в 1999 году использовалась 5-ступенчатая механическая коробка передач. 1 В последующих моделях применялась 6-ступенчатая трансмиссия. 4
• Подвеска: в 1999 году использовалась специально настроенная подвеска (спереди и сзади независимая пружинная). 1 В моделях EP3 конструкция шасси была упрощена: передняя двухрычажная подвеска уступила место стойкам Макферсона. 4
• Комплектация: в 1999 году в автомобиле были CD-плеер, покрашенные в цвет кузова электрические зеркала, электростеклоподъёмники, кондиционер, центральный замок с кнопкой на брелке, алюминиевые спортивные педали и центральная панель, выполненная из карбона. 23