Некоторые модификации на базе УАЗ-3303:

• УАЗ-39095. 12 Грузовой автомобиль с вставкой шириной 340 мм между дверями и задней стенкой, колёсной базой, растянутой на 230 мм. 12
• УАЗ-330362. 1 Грузовик с удлинённой колёсной базой на 250 мм и опущенной грузовой платформой на 100 мм. 1 На основе этой модели создан изотермический фургон «Термос» (УАЗ-2746). 1
• УАЗ-330365. 1 Модификация с увеличенной до 2,55 м колёсной базой, металлической или деревянной платформой грузоподъёмностью 1225 кг. 1 С 2018 года выпускается как базовая с двигателем ЗМЗ-40911.10 5-го экологического класса. 1
• УАЗ-330945 «Фермер». 1 Грузовой автомобиль с удлинённой до 2,55 м колёсной базой, 5-местной кабиной и бортовой платформой грузоподъёмностью до 1025 кг с двумя откидными 2-местными скамейками. 1
• УАЗ-33032. 3 Модификация с установленным газовым оборудованием. 3
• УАЗ-33034. 3 Экспериментальный 10-местный автомобиль. 3
• УАЗ-33035. 3 Модификация с металлическим кузовом иной формы с меньшей погрузочной высотой. 3
• УАЗ-33036. 3 Модификация с увеличенной базой шасси (2550 мм), металлической платформой, мягкими сиденьями и обивкой. 3

Кроме того, на базе УАЗ-3303 изготавливалось много модификаций сторонними фирмами и заводами, например, подъёмник автомобильный гидравлический, автомобиль для коммунальных служб, санитарный автомобиль Самарского завода САРЗ-2925 и другие. 3