Отличить ВАЗ-21099 от ЗАЗ-21099 можно по отсутствию пластиковой накладки на ВАЗ-21099. 1 На эту модель с самого начала не ставили пластиковую накладку, в то время как на ЗАЗ-21099, выпускавшийся на украинском заводе до 2011 года из российских машинокомплектов, её ставили. 1

В остальном автомобили похожи, так как ЗАЗ-21099 был почти полным аналогом ВАЗ-21099. 1

Также от остальных моделей семейства «Самара» ВАЗ-21099 изначально отличала передняя часть кузова с длинными крыльями, без пластикового «клюва» спереди и с более длинным капотом, новая решётка радиатора, панель приборов серого цвета, в отличие от коричневых панелей на других «Самарах». 4