Некоторые отличия модели Honda CB400 Super Four Hyper VTEC II от базовой версии:

• Изменённая работа системы VTEC. 1 Система запускается при 6300 оборотах в минуту, а не при 6750, как в предыдущей версии. 13
• Обновлённая карта опережения зажигания. 1
• Интеграция дополнительных приборов. 1 В циферблаты спидометра и тахометра интегрированы жидкокристаллический одометр, счётчик пробега, часы и указатель уровня топлива. 1
• Система защиты от шипящего зажигания. 1
• Снижение шума всасываемого воздуха. 1 Это достигнуто за счёт повышения жёсткости поверхности корпуса воздухоочистителя. 1
• Замена некоторых деталей. 1 Установлены более лёгкий масляный фильтр меньшего размера и суппорты передних тормозов от модели super-sport CBR900RR. 1
• Защитные щитки на трубках передней вилки. 1
• Увеличение веса. 1 Мотоцикл стал тяжелее на 1 кг. 1