Разница между папками на рабочем столе и в системном хранилище Android заключается в их назначении и доступе к ним:

• Папки на рабочем столе позволяют упорядочить приложения и файлы, объединив их в отдельные каталоги для упрощённого доступа. 1 Доступ к ним осуществляется через приложение «Проводник» или «Менеджер файлов». 1
• Папки в системном хранилище содержат системные файлы и информацию, необходимую для функционирования Android. 15 Доступ к ним можно получить через предустановленное средство Google Files, перейдя во внутреннюю память или съёмный SD-накопитель. 4

Таким образом, папки на рабочем столе предназначены для пользовательских данных, а папки в системном хранилище — для системных файлов и информации, важной для работы устройства. 35