Разница между join и merge в компьютерных системах управления версиями заключается в том, что join используется для быстрого объединения по индексам, а merge — для более сложных объединений. 2

Join подразумевает создание новой версии элемента, для которой в качестве основы берётся базовая версия на выбранной ветке (база), и к ней применяются изменения, содержащиеся в выбранной сторонней версии (источнике). 3

Merge позволяет осуществить детальную настройку слияния по различным ключам и опциям. 2 По умолчанию он выполняет внутреннее объединение, то есть сохраняет только строки с совпадающими ключами в обоих фреймах данных. 1 В отличие от функции join, которая по умолчанию работает с индексами, merge позволяет указать, какие столбцы следует использовать в качестве ключей для объединения. 1