Основные различия между форматами PE и NE в исполняемых файлах:

• Простота загрузки. 1 Для PE-файла этот процесс проще, чем для NE-файла: чтобы загрузить NE-файл, загрузчик должен создать рабочие структуры в памяти и найти информацию для их заполнения внутри файла. 1
• Поддержка сплошной модели памяти. 1 Конструкция PE-файла максимально упрощена с точки зрения загрузки в память: фактически он представляет собой слепок участка оперативной памяти. 1
• Управление вспомогательными данными. 4 В NE-файлах ресурсы не считаются сегментами, информация о них не хранится в таблице сегментов заголовка файла, а сведена в отдельную таблицу в конце заголовка. 4 В PE-файлах всё, что считается важным программным кодом или данными, хранится в полнокровной секции. 4
• Хранение расположений элементов. 4 В PE-формате расположения элементов хранятся в виде простых смещений, а в NE-формате — в виде величины сектора. 4