Единая биометрическая система (ЕБС) и собственные биометрические системы банков отличаются кругом решаемых задач, объёмами накопленных данных и подходами к обеспечению безопасности. 3

Некоторые отличия:

• Задачи. 5 ЕБС предназначена для привлечения новых клиентов, чтобы человек мог получать услуги разных банков дистанционно, без визитов в офис. 5 Биометрические системы банков, в свою очередь, в основном работают со старыми клиентами. 3
• Процесс сбора данных. 5 Собственную биометрическую систему банк может заполнить слепками по своим цифровым каналам (через смартфоны), клиентам не нужно приходить в отделение. 5 ЕБС подразумевает обмен данными между тремя разными участниками — оператором системы, банком, принявшим биометрические данные, и банком, идентифицирующим клиента. 5
• Требования к безопасности. 5 Собственная биометрическая система действует в периметре информационной безопасности банка, следовательно, данные уже надёжно защищены имеющимися средствами. 5 ЕБС требует других средств защиты информации, для внедрения которых требуются значительные инвестиции. 5
• Объём данных. 3 В биометрических системах банков счёт образцам биометрии может идти на миллионы. 3 В ЕБС, по состоянию на осень 2020 года, число образов данных не превышало 200 тыс.. 3

К 30 сентября 2023 года все банки сдали накопленные массивы биометрических данных в ЕБС, а взамен получили возможность за установленную плату получать из неё зашифрованные биометрические данные о клиентах. 3