Структура Министерства юстиции Российской Федерации включает:

1. Руководство. 1 Министерство возглавляет министр юстиции, у него семь заместителей, в том числе уполномоченный при Европейском суде по правам человека и статс-секретарь. 25
2. Центральный аппарат. 4 В него входят 19 департаментов по основным направлениям деятельности. 4 Некоторые из них: департамент регистрации ведомственных нормативных правовых актов, департамент государственной службы и кадров, департамент управления делами и другие. 14
3. Территориальные органы. 25 В каждом субъекте Российской Федерации есть по одному территориальному органу со своей структурой. 2 Они выполняют те же функции, но уже на местах. 2

Также к подведомственным Минюсту организациям относятся, например, Государственная регистрационная палата, Федеральное агентство по правовой защите результатов интеллектуальной деятельности, Российский федеральный центр судебной экспертизы, Научный центр правовой информации и Российская правовая академия. 5