Особенности питания бактерий в различных экологических нишах заключаются в разных способах питания бактерий:

• Гетеротрофные бактерии питаются готовыми органическими веществами. 24 Например, бактерии-паразиты питаются за счёт ресурсов организма-хозяина, а бактерии-сапротрофы потребляют вещества мёртвых остатков и выделений других организмов. 2
• Автотрофные бактерии не нуждаются в органических веществах, но способны сами производить их. 2 Цианобактерии используют энергию солнечного света и осуществляют фотосинтез. 2 Серобактерии, железобактерии, водородные бактерии способны преобразовывать неорганические вещества, использовать энергию, выделяющуюся при этих химических реакциях, и направлять её на синтез органических веществ. 2

Таким образом, особенности питания бактерий в разных экологических нишах зависят от доступных питательных веществ и условий среды обитания.