Основные принципы палеоэкологии как междисциплинарной науки:

1. Актуализм. 23 Методический подход, предполагающий, что в различные геологические периоды действовали одни и те же экологические законы. 2 То есть экологию ископаемых организмов можно изучить на основе накопленных данных о родственных или подобных современных видах. 2
2. Построение подробной модели условий жизни древних организмов. 2 Реконструкция осуществляется с учётом сложного взаимодействия между экологическими факторами — температурой атмосферы, питательной средой, степенью солнечного освещения и т. д.. 2
3. Использование морфо-функционального анализа. 2 Учёные изучают строение скелетных остатков древних организмов, что позволяет частично восстановить их образ жизни и условия обитания. 2
4. Акцент на систематические полевые исследования. 3 Детальность и тщательность наблюдений, осуществлённых на месте, делают материалы более информативными. 3