Значение закона независимого наследования Менделя для современной генетики заключается в том, что он служит основой для предположения о существовании в клетках (гаметах) наследственных факторов, контролирующих развитие признаков. 2

Согласно этому закону, гены и соответствующие им признаки наследуются и свободно комбинируются в потомстве во всех возможных сочетаниях. 15 В результате среди потомков второго поколения в определённом соотношении появляются особи с новыми (по отношению к родительским) комбинациями признаков. 2

Также законы Менделя стали фундаментом для концепции, что наследственные факторы (сегодня называемые генами) относительно постоянны, хотя и могут находиться в различных состояниях, парны в соматических клетках и единичны в гаметах, дискретны и могут вести себя независимо по отношению друг к другу. 2