Разница между внутривидовой и межвидовой гибридизацией в селекции заключается в том, что при первой скрещивают особей одного вида, а при второй — разных видов. 12

Внутривидовая гибридизация распространена в селекции растений, с её помощью создано большинство современных сортов сельскохозяйственных растений. 4 При скрещивании между собой разных сортов растений или пород животных одного вида первое гибридное поколение отличается улучшенными признаками, например крупными размерами, повышенной устойчивостью и плодовитостью. 2

Межвидовая (отдалённая) гибридизация используется для получения гибридов, сочетающих ценные свойства родительских форм. 1 Обычно отдалённые гибриды бесплодны, так как хромосомы родительских видов отличаются настолько, что невозможен процесс конъюгации, в результате чего нарушается мейоз. 1