Разница между «не вошедшие» и «невошедшие» заключается в написании. 1
Русский язык допускает оба варианта, но слитное написание «невошедшие» используется крайне редко (обычно в неполных фразах). 1
Раздельное написание «не вошедшие» применяется, когда у причастия есть зависимое слово. 14 Например: «не вошедшие в список книги», «не вошедшие в фильм эпизоды» и т. д.. 1