Разница между факультативными и облигатными внутриклеточными паразитами заключается в их способности к жизни и размножению: 1

• Факультативные внутриклеточные паразиты способны жить и размножаться как внутри клеток-хозяев, так и вне их. 1
• Облигатные внутриклеточные паразиты нуждаются в клетке-хозяине, чтобы жить и размножаться. 1 Они не могут размножаться вне клетки-хозяина, их размножение полностью зависит от внутриклеточных ресурсов. 1

Таким образом, факультативные паразиты, как правило, ведут свободный образ жизни и лишь при особых условиях переходят к паразитическому состоянию, а облигатные паразиты ведут только паразитический образ жизни и не выживают без связи с хозяином. 3