Разница между экзонами и интронами в структуре гена у эукариот заключается в их функциях:

• Экзоны — смысловые участки, несут информацию о структуре белка. 5 Они присутствуют как в первичном транскрипте, так и в мРНК. 3 Экзоны участвуют в процессе трансляции (образовании белка). 1
• Интроны — несмысловые участки, не несут информацию о структуре белка. 5 Они присутствуют в первичном транскрипте РНК, но отсутствуют в матричной РНК. 3 Интроны удаляются из первичного транскрипта и отсутствуют в зрелой мРНК, которая состоит только из экзонов. 2

Количество экзонов и интронов индивидуально для каждого гена и зависит от сложности кодируемого белка. 23 При этом интроны чаще всего длиннее экзонов. 3