Разница между Counter и другими контейнерами Python заключается в их назначении:

• Counter — это контейнер, который подсчитывает количество вхождений элементов. 1 Он является подклассом словаря. 1
• defaultdict — это словарь, который возвращает значение по умолчанию для несуществующих ключей. 1 Это удобно, когда нужно избежать ошибок KeyError при добавлении новых элементов. 1
• deque (двусторонняя очередь) — это контейнер с быстрым добавлением и удалением элементов с обеих сторон. 1
• namedtuple — это фабрика для создания кортежей с именованными полями. 1 Они позволяют создавать читаемые и самодокументируемые коды. 1

Таким образом, Counter используется для подсчёта элементов последовательности, а другие контейнеры имеют свои особенности и задачи: defaultdict возвращает значение по умолчанию для несуществующих ключей, deque позволяет быстро добавлять и удалять элементы, а namedtuple создаёт кортежи с именованными полями 135.