Выдра является редким видом, несмотря на повсеместную распространённость, по нескольким причинам:

• Охота. 4 Выдры бесконтрольно истреблялись из-за меха, что привело к сокращению численности вида. 4
• Загрязнение водоёмов и ухудшение гидрологического режима рек из-за рубок леса и применения пестицидов. 14
• Сокращение рыбных запасов — основного корма выдры. 1
• Промерзание водоёмов зимой. 15 Это лишает выдр возможности осваивать даже богатые кормом водоёмы или вынуждает их к опасным сезонным переходам. 1
• Появление пищевых конкурентов. 1 Например, акклиматизация в водоёмах американской норки, которая стала конкурентом выдры. 1

В 2000 году обыкновенная выдра была внесена в красный список Всемирного союза охраны природы (IUCN) как «уязвимый» вид. 24