Почему в некоторых словах буквы е, ё, ю, я не учитываются при звуковом анализе?

Буквы «е», «ё», «ю», «я» не учитываются при звуковом анализе в некоторых словах, если идут после согласного. 14 В таком случае они обозначают один звук и указывают на мягкость предыдущего согласного звука. 2

Два звука эти буквы обозначают в трёх случаях: 1

1. В начале слова. 15 Например, «ель» — [й’эл’]. 2
2. После гласной. 1 Например, «прыгает» — [прыгай’эт]. 1
3. После разделительных «ь» и «ъ». 13 Например, «объезд» — [абй’эст], «поленья» — [пал’эн’й’а]. 1

Если буквы «е», «ё», «ю», «я» идут после согласного, то двух звуков не будет. 1