Несколько причин, по которым разнообразие беспозвоночных животных в России остаётся малоизученным:

• Сложности с изучением этих животных. 1 Для большинства видов ещё нет методик количественных учётов, недостаточно специалистов по отдельным группам беспозвоночных. 1 Также есть трудности в определении систематики групп и недостатке данных о биологии видов. 1
• Особенности биологического разнообразия России. 3 Многие виды заходят на территорию страны лишь краем своего ареала и поэтому, не будучи редкими в пределах всего видового ареала, являются регионально редкими для территории России. 3
• Ухудшение местообитаний беспозвоночных. 2 Особенно в последние годы резко ухудшаются их местообитания, что приводит к уничтожению, трансформации и разобщению природных сообществ. 2