Признаки, связанные с Y-хромосомой, наследуются только по мужской линии, потому что мужские клетки содержат только одну копию Y-хромосомы, в то время как Х-хромосомы имеют две копии, по одной от каждого родителя, что допускает рекомбинацию. 3

Y-хромосома, как правило, не подвергается генетической рекомбинации, и только небольшие области, называемые псевдоаутосомными областями, проявляют рекомбинацию. 3 Большинство генов Y-хромосомы, которые не рекомбинируют, расположены в «нерекомбинирующей области». 3

Таким образом, особое положение Y-хромосомы даёт возможность генам, расположенным в ней, влиять только на мужскую особь и «не беспокоиться» о том, как они влияют на особей женского пола. 4