Плейотропия может ограничить скорость эволюционного процесса, потому что мутация в одном гене может иметь пагубное воздействие на многие другие признаки организма. 1 Особенно если этот ген задействован в регулировании других генов. 1

Также антагонистическая плейотропия может привести к изменению эволюционного пути с задержкой приспособления. 4 При этом она придаёт большую эволюционную «выносливость» генам, контролирующим полезные признаки, поскольку организм с мутацией этих генов будет иметь меньшие шансы на успешное воспроизводство, поскольку это затронет несколько признаков, потенциально к худшему. 4

Таким образом, плейотропия не позволяет мутациям, которые являются основным двигателем эволюционного процесса, фиксироваться в популяции. 1