Некоторые причины, по которым изомеры могут иметь разные биологические свойства:

• Пространственное расположение атомов. 3 Оно влияет на взаимодействие изомеров с биологическими рецепторами, ферментами или другими молекулами. 3
• Особенности проникновения в организм. 1 Они связаны со строением и свойствами биологических мембран и наличием в них специальных систем, осуществляющих перенос метаболитов через мембраны. 1
• Структурное сродство к мишени. 4 «Сайт связывания» белка-мишени распознаёт не структуру молекулы целиком, а лишь расположение отдельных атомов. 4 Исходя из этого белковая молекула либо останавливает свою работу, либо активируется. 4

Например, у хиральных соединений, как правило, биологической активностью обладает лишь один изомер, или эффекты L- и D-изомеров сильно различаются. 2