Комплементарное взаимодействие важно в синтезе белков, потому что обеспечивает прочность и специфичность связывания. 3

Для биосинтеза белка необходима информация о последовательности соединения аминокислот, которая записана в виде последовательности кодонов в мРНК. 3 Аминокислоты доставляются к рибосомам транспортными РНК (тРНК), и аминокислота попадает в рибосому только в комплексе с соответствующей тРНК. 4

Если тРНК имеет антикодон, не комплементарный кодону в мРНК, связывание становится значительно менее прочным, и комплекс мРНК–тРНК быстро распадается. 3

Кроме того, в результате комплементарного взаимодействия обе структуры изменяются: открываются новые участки на молекуле белка, чего раньше не было. 2 Это позволяет организовать новую серию взаимодействий, что важно для организации биологических каскадов. 2