Исследования древнейших пород часто не подтверждают наличие окаменелостей живых организмов по нескольким причинам:

• Условия для сохранения останков были не всегда благоприятными. 1 Например, если погибшее животное попадало на вершину или выступ в скале, грунт вымывался водными потоками и выдувался ветрами, обнажая подстилающие горные породы. 1 В таких условиях погребение остатков было практически невозможно. 1
• Остатки большинства крупных животных не успевали полностью погрузиться в осадочные породы. 1 До наших дней дошли только части их скелетов или другие фрагменты туш. 1
• Обычно сохраняются только твёрдые части организмов, например кости, зубы, хитиновые панцири, раковины. 3 Мягкие ткани разлагаются слишком быстро и не успевают заместиться минеральным веществом. 3
• Некоторые породы бедны окаменелостями. 3 Например, чистые кварцевые песчаники и кварциты, особенно залегающие сплошными толщами, очень бедны окаменелостями. 3
• Сильно метаморфизованные породы содержат органические остатки только в крайне редких случаях в очень плохом состоянии. 3 При изменении и перекристаллизации породы скелеты исчезают или сливаются с массой породы. 3