Фрагменты Оказаки важны в процессе репликации ДНК у прокариот, потому что они обеспечивают прерывистый синтез отстающей цепи. 15
На одной материнской цепи синтез идёт в сторону расхождения вилки и происходит непрерывно, без разрывов. 1 На второй матрице синтез идёт в обратную сторону от направления расхождения цепей исходной ДНК, поэтому может идти только кусками — фрагментами Оказаки. 1 Позже такие фрагменты «сшиваются» между собой. 1
Кроме того, дефекты созревания фрагментов Оказаки могут потенциально вызывать разрыв цепей ДНК и различные формы хромосомных аномалий. 2
Также фрагменты Оказаки представляют собой набор нуклеотидов для отстающей цепи, и любое изменение в них может вызвать мутацию, если не будет обнаружено и не зафиксировано. 2