Агрофитоценоз считается более сложным сообществом, чем природное растительное сообщество, по нескольким причинам:

• Источник энергии. 12 Природные экосистемы получают энергию только от Солнца. 1 Для существования агроценоза помимо Солнца требуется ещё много энергии: на возделывание почвы, внесение удобрений, борьбу с вредителями и сорными травами, болезнями. 1
• Видовое разнообразие. 12 В природе видов очень много, пищевые цепи разветвлённые. 1 В агроценозах сильно снижено видовое разнообразие организмов. 2 Это следствие искусственного отбора, проводимого человеком. 2 С одной стороны, человек размножает высокоурожайные сорта определённых видов, с другой, постоянно борется с нежелательными видами, называемыми сорняками и вредителями. 2
• Особенности биологического круговорота. 12 В природных экосистемах он практически замкнут — первичная продукция возвращается в систему в результате круговорота веществ. 1 А в агроценозах круговорот незамкнутый, он нарушен — человек изымает весь урожай и искусственно поддерживает плодородие почвы с помощью удобрений. 1
• Механизм регуляции. 1 Естественные экосистемы саморегулируются. 1 Агроценоз почти полностью регулируется человеком. 1
• Продуктивность. 1 В природе она зависит от природных условий. 1 Агроценозы отличаются высокой продуктивностью, благодаря действиям человека. 1