Может ли быть такое, что наша вселенная это протон или нейтрон в каком-нибудь атоме, а мультивселенная это другие частицы?

Нет, это не так. 1 Учёные достаточно знают о строении протонов и нейтронов, чтобы утверждать, что в них вселенных нет. 1

Однако существует гипотеза одноэлектронной Вселенной Ричарда Фейнмана, в основе которой лежит предположение, что наша Вселенная — всего лишь один атом, который состоит из множества других частиц. 2 Эту теорию невозможно доказать или опровергнуть. 2