Роль микроорганизмов в биогенной миграции атомов заключается в том, что они превращают остатки животных и растений в элементарные органические вещества, которые используются зелёными растениями для синтеза новой органики. 1

Микроорганизмы превращают белки, жиры, углеводы и другие богатые энергией органические соединения в более простые, бедные энергией, вплоть до конечных продуктов — углекислого газа и воды. 4 Так микробы очищают ландшафт от остатков организмов. 4

Кроме того, благодаря деятельности микроорганизмов, бактерий и водорослей, большая часть азота поступает в почву и воду. 3 Например, клубеньковые бактерии на корнях бобовых растений, находящиеся с ними в симбиозе, переводят атмосферный азот в аммиак и аммонийные соли, которые необходимы для роста и развития растения. 3