Значение гомозигот в селекции растений и животных заключается в том, что они гарантированно передают определённый признак своему потомству. 2 Это полезно для селекционеров, когда нужно убедиться, что нужный признак передаётся по наследству. 2

В селекции растений инбридинг (близкородственное скрещивание) используется для перевода генов в гомозиготное состояние и получения чистых линий. 3 При скрещивании чистых линий образуются гибриды, у которых ярко выражен гетерозис (увеличение жизнеспособности, продуктивности, устойчивости к болезням). 3

Однако гомозиготизация при инбридинге может вести к ослаблению животных, снижению их устойчивости к воздействию среды, повышению заболеваемости. 1 Поэтому за инбридингом следует скрещивание разных межлинейных гибридов, в результате которого нежелательные рецессивные аллели переводятся в гетерозиготное состояние и вредные последствия близкородственного скрещивания снижаются. 1