Некоторые преимущества конфокальной лазерной сканирующей микроскопии по сравнению с другими методами:

• Улучшенная разрешающая способность. 1 Это достигается благодаря использованию лазеров в качестве источников света. 1
• Высокая контрастность изображения. 1 Это достигается за счёт уменьшения фоновой флуоресценции и улучшения отношения сигнал-шум. 4
• Возможность проводить мультиспектральные исследования с высокой степенью разделения сигналов. 1
• Получение «оптических срезов» с трёхмерной реконструкцией. 1 Специальные программы позволяют из серии оптических срезов создавать объёмные изображения объектов, а также рассматривать их под разными углами зрения. 1
• Цифровая обработка полученных изображений. 15 Это позволяет сохранять изображения и детально изучать полученные данные. 1