Основное правило употребления корней «клан» и «клон» в русском языке связано с чередованием гласных. 14
В ударной позиции пишется и «клан», и «клон» в соответствии с произношением. 3 Примеры: поклониться, поклон, преклонить, кланяться, поклонение, склоняться, клониться, склонить. 3
В безударном положении пишется исключительно «клон». 3
Кроме того, есть омонимичные слова: «клан» (из англ. — семья, потомство) и «клон» (из греч. — ветвь, отпрыск). 1 Правописание слов с этими корнями не подчиняется правилу чередования. 1 В таких словах безударная гласная проверяется ударением: клонировать (клон). 1