Некоторые механизмы, которые контролируют процесс дифференцировки клеток в многоклеточном организме:

• Клеточная сигнализация. 1 Сигнальные молекулы, например факторы роста, передают информацию от клетки к клетке, способствуя процессу дифференцировки. 1
• Сигнальная индукция. 1 Это каскад событий, во время которого клетка или ткань подаёт сигналы другой клетке или ткани, чтобы повлиять на судьбу её развития. 1
• Эпигенетический контроль. 14 Поскольку каждая клетка обладает одним и тем же геномом, определение типа клетки происходит на уровне экспрессии гена. 1 Эпигенетические процессы играют решающую роль в регулировании решения о выборе стволовой клетки, предшественницы или зрелой клетки. 1
• Химические или физические сигналы. 4 Они поступают от других клеток, от внеклеточного матрикса или (преимущественно у растений) из внешней среды. 4 Эти сигналы влияют на цитоскелет, ферментные системы клетки и её генетический аппарат. 4