Некоторые факторы, влияющие на уровень комбинативной изменчивости в популяции:

• Половой способ размножения. 23 При нём возникают новые сочетания генов, которые являются источником комбинативной изменчивости. 23
• Кроссинговер. 23 Этот процесс повышает разнообразие гамет за счёт перекомбинации генов в ходе мейоза между гомологичными хромосомами. 4
• Случайное сочетание гамет при оплодотворении. 23 Также источником комбинативной изменчивости можно считать случайный подбор родительских пар. 23

Кроме того, на уровень комбинативной изменчивости влияют популяционные волны — изменения численности особей в популяциях, возникающие под влиянием среды и ведущие к изменению интенсивности естественного отбора и генетической структуры популяции. 1