Шероховатый эндоплазматический ретикулум (ЭПР) влияет на синтез и транспорт белков в клетке следующим образом:

Синтез белков происходит благодаря рибосомам, расположенным на шероховатой ЭПС. 13 Белки поступают в каналы ЭПР, созревают (приобретают третичную структуру) там и транспортируются. 1

При транспортировке по ЭПС белок приобретает ряд других изменений, например фосфорилирование или превращение в гликопротеин. 1

Большинство белков, оказавшихся в шероховатой ЭПС, далее попадают в аппарат (комплекс) Гольджи. 1 Оттуда белки либо секретируются из клетки, либо поступают в другие органоиды (обычно лизосомы), либо откладываются как гранулы запасных веществ. 1