Праймеры используются в молекулярной биологии для инициирования синтеза ДНК. 12

Некоторые примеры применения праймеров:

• Полимеразная цепная реакция (ПЦР). 13 Для неё используют пару специальных праймеров, которые направляют удлинение ДНК друг к другу на противоположных концах амплифицируемой последовательности. 1
• Метод полимеразной цепной реакции после обратной транскрипции (ОТ-ПЦР). 34 ОТ-ПЦР характеризуется высокой чувствительностью и используется для относительной количественной оценки экспрессии генов на уровне мРНК. 3
• Секвенирование ДНК. 15 Многие лабораторные методы в биохимии и молекулярной биологии, которые предполагают использование ДНК-полимеразы, требуют наличия праймеров. 5
• Методы, позволяющие различить близкие по генетической последовательности организмы. 5 Например, RAPD PCR, в котором используют праймер небольшого размера, частично комплементарный случайным участкам ДНК исследуемых организмов. 5

В живых организмах используются РНК-праймеры, а для лабораторных методов, требующих синтеза ДНК in vitro, применяют ДНК-праймеры, так как они более температурно стабильны. 1