Пероксисомы влияют на метаболические процессы в клетках следующим образом:

• Расщепляют жирные кислоты с очень длинной цепью путём бета-окисления. 1 В клетках животных длинноцепочечные жирные кислоты превращаются в среднецепочечные, которые впоследствии доставляются в митохондрии, где в конечном итоге расщепляются до углекислого газа и воды. 1 В дрожжевых и растительных клетках этот процесс осуществляется исключительно в пероксисомах. 1
• Участвуют в катаболизме жирных кислот с очень длинной цепью, жирных кислот с разветвлённой цепью, промежуточных продуктов желчных кислот (в печени), D-аминокислот и полиаминов. 1
• Играют важную роль в биосинтезе плазмалогенов: эфирных фосфолипидов, имеющих решающее значение для нормального функционирования мозга и лёгких млекопитающих. 1
• Участвуют в выработке желчных кислот, важных для усвоения жиров и жирорастворимых витаминов, таких как витамины А и К. 1
• Регулируют окислительно-восстановительное равновесие внутри клетки и концентрацию активных форм кислорода. 25