Пептиды отличаются от белков по размеру и структуре. 1

По размеру пептиды меньше белков: традиционно пептиды определяются как молекулы, состоящие от 2 до 50 аминокислот, тогда как белки состоят из 50 или более аминокислот. 1

По структуре пептиды, как правило, менее чётко очерчены, чем белки, которые могут принимать сложные конформации (вторичные, третичные и четвертичные структуры). 1

По свойствам пептиды способны к гидролизу — полному или частичному, в результате которого происходит расщепление пептидной цепи. 2 В отличие от белков, пептиды, как правило, не имеют в растворе третичной структуры и не претерпевают необратимой денатурации. 3