Особенности пигментации влияют на изменение цвета глаз следующим образом: итоговый цвет глаз зависит от количества пигмента меланина, находящегося в радужной оболочке. 1

В переднем мезодермальном слое находятся хроматофоры, содержащие меланин. 1 От того, каким образом и в какой концентрации они распределены, и зависит окончательный цвет глаз человека. 1 Чем больше меланина находится в переднем слое, тем темней будет цвет глаз (чёрный, карий и родственные). 1 Если пигмента меньше, то оттенок обычно зелёный или голубой. 1

Также на окончательный оттенок влияет расположение сосудов и плотность волокон радужной оболочки. 1 Например, синий оттенок радужки обусловлен малым содержанием меланина, а также малой плотностью волокон её внешнего слоя. 5

Кроме того, на цвет глаз может влиять и другой пигмент — жёлтый липофусцин. 3 Именно он при условии малого содержания меланина делает радужки зелёными. 3