Гистоны способствуют компактизации ДНК в клеточном ядре следующим образом:

1. Гистоны нуклеосомного кора (H2A, H2B, H3 и H4) участвуют в формировании основной структурной единицы хроматина — нуклеосомы. 1 Белковые молекулы как бы образуют катушку, на которую примерно в 2 оборота намотана нить двуспиральной ДНК. 2 При этом происходит жёсткая фиксация ДНК и образуется универсальная структура нуклеосомы. 1
2. Линкерные гистоны (H1 и Н5) связываются с межнуклеосомными сегментами ДНК, обеспечивая стягивание нитей ДНК на входе и выходе из нуклеосом. 1 Роль линкерных гистонов состоит в упаковке нуклеосом в структуры более высокого порядка. 1