Плазмиды в жизнедеятельности бактерий выполняют различные функции, которые зависят от того, какие гены они в себе несут. 5 Некоторые из них:

• Адаптация к условиям среды. 2 Плазмиды содержат гены, которые повышают приспособленность бактерий к окружающей среде, например, обеспечивают устойчивость к антибиотикам, тяжёлым металлам, УФ-излучению. 12
• Передача генетического материала. 2 Плазмиды обеспечивают горизонтальный перенос генов, который широко распространён у бактерий, а также перенос генов между прокариотами и эукариотами. 2
• Контроль вирулентных свойств. 3 Плазмиды патогенности контролируют вирулентные свойства многих видов, особенно энтеробактерий. 3
• Синтез определённых веществ. 1 Плазмиды могут содержать гены, ответственные за сбраживание сахаров, гидролиз мочевины или образование сероводорода. 1
• Разрушение потенциально токсичных соединений. 1 Гены, содержащиеся в плазмидах, могут давать возможность бактериям разрушать вредные для окружающей среды соединения. 1
• Компенсация дефектов метаболизма. 3 Регуляторные плазмиды участвуют в компенсировании тех или иных дефектов метаболизма бактериальной клетки посредством встраивания в повреждённый геном и восстановления его функций. 3