Основное отличие синтеза АТФ в митохондриях от фотосинтеза в хлоропластах заключается в источниках энергии и целях процессов:

1. В митохондриях АТФ образуется в результате окислительного фосфорилирования при окислении субстратов — углеводов, жирных кислот. 13 Энергия АТФ, образующихся в митохондриях, тратится на все потребности клеток. 1
2. В хлоропластах АТФ синтезируется в ходе световой фазы фотосинтеза и расходуется на ассимилляцию углерода в темновую фазу фотосинтеза. 1 Процесс образования АТФ из АДФ за счёт световой энергии отличается высокой эффективностью: за единицу времени в хлоропластах синтезируется в 30 раз больше АТФ, чем в кислородном этапе энергетического обмена в митохондриях. 5